大军乘坐战船，从泉州出发，并非是走直线到达台湾，需要绕道，从福建到台湾的航线，基本固定下来了，有两条线路可供选择，其一是从泉州出发，直接到台湾的基隆，这条线路距离是最短的，但基隆在台湾的最北边，距离荷兰军队主要驻地台湾南部，尚有一定的距离，虽说荷兰殖民者也占据了北边的基隆和淡水两个港口，但在这里的统治基础是比较薄弱的，主要的力量还是分布在南方的澎湖列岛、嘉义、台南和高雄等地，大军直接抵达基隆，不可能一举歼灭荷兰殖民者的主力军队。
其二就是从泉州航行到漳州府所属的厦门岛，从厦门岛出发，攻占金门岛、澎湖列岛，登岸之后，攻打嘉义、台南和高雄，给予荷兰殖民者毁灭性的打击，接着大军兵分两路，一路走海路，到达基隆和淡水，一路走陆路，沿路收复台湾驻地，最终两军在基隆会合，彻底剿灭荷兰殖民者的军队，全面收复台湾。
孙传庭做出来的决定，是走第二条路线。
这也是因为孙传庭和渠清泽等人掌握的情报，逃出福建的一些商贾，盘踞在金门岛，形成了一股不大不小的势力，这里距离泉州还有一定的距离，加之孙传庭带领江宁营水师到达泉州之后，熊子健的一切安排，都是以江宁营为主，暂时没有对盘踞在金门岛的势力进行围剿，一段时间过去，这些势力逐渐开始演变为海盗的性质了。
既然要收复台湾，当然也要全面收复台湾海峡所有的岛屿，不能够留下一丝的隐患。
泉州距离漳州不是很远。
战船编队在大海上航行了三天。抵达了金门岛附近。
尽管说盘踞在金门岛的商贾，包括他们的护卫，隐隐知道了一些消息，但他们认为在大海上，逃生是很容易的。因为他们的船只灵活，看见局面不利，就可以迅速的逃走，等到大军离开之后，他们回到金门岛，继续做海盗的勾当。继续想办法撕开缺口，从事海上走私的勾当，赚取大把的银子。
可惜这一次，他们的判断出现了致命的失误。
江宁营水师的大小船只，达到了三百余艘，其中有接近一半的中型和小型的船只。机动灵活，加之这一次，苏天成下定了决心，必须要平定台湾岛，所以孙传庭和熊子健等人，是高度重视的，列出了详细的计划。大型战船在外围，中型战船和部分的小型战船在中间，其余的小型战船在最前面，这样三层包围下来，驻扎在金门岛的商贾，除了乖乖的投降，没有其他的出路了。
战斗在二月二十一日的辰时打响。
对于苏天成和江宁营水师来说，这不算是战斗，盘踞在金门岛的商贾，看见情势不对。很快就放弃了抵抗，乖乖的投降了。
刘铁汉和王大治两人，率领江宁营将士登上金门岛，还没有彻底展开厮杀，岛上的商贾。就开始缴械了，两人没有遇见什么像样的抵抗，还是有些郁闷的，他们也很奇怪，不管怎么说，厮杀还是必要的啊，双方都没有怎么交手，怎么对付这么快就投降了。
刘铁汉带着几个商贾，很快来到了苏天成的面前。
几个商贾面无血色，跪在苏天成的面前，身体瑟瑟发抖。
苏天成冷冷的看了他们一眼，这些所谓的商贾，富甲一方，完全是依靠走私发财的，嘉靖年间的时候，这样的商贾，力量是非常强大的，甚至勾结倭寇，从事走私和劫掠的活动，曾经被戚继光狠狠的打击，几十年过去了，想不到如今再次出现了。
对这些人，苏天成不会客气。
王大治已经提前来禀报了，这些商贾知晓征缴他们的大军是江宁营的时候，就自动放弃了抵抗，江宁营的名气太大了，他们知道没有机会，而且庞大的船队，重重的包围，也令他们没有逃跑的机会了，就算是强行的逃跑，最终也是被剿灭的命运。
“你们既然投降了，就应该知道规矩，江宁营不杀投降之人，你们的性命可以保住，但必须将所有的财产交出来，给你们一个时辰的时间，上缴所有的财产，一个时辰之后，将士在岛上搜索，若是发现了黄金白银珠宝，你们就不要想着能够保住性命了。”
一个时辰之后，堆积如山的黄金白银，数不清的粮食、布匹、茶叶和食盐等货物，摆放在小岛的平地上面，就连苏天成都感觉到吃惊了。
周围被严密戒严了，除开少数的军官，以及亲兵营的将士，任何人都是不准靠近的。
货物很快开始清点，陆续搬运到船上去。
刘铁汉带领斥候营的将士，开始在岛上搜索。
金门岛很是荒芜，小岛的面积虽然不小，但绝大部分地方，几乎都看不到什么人烟，曾经也有渔民生活在岛上，但这些商贾占据了金门岛之后，撵走了所有的渔民和住户，对于躲藏在岛上的渔民，发现之后，一律残杀，导致了岛上所有的渔民逃走了，有些渔民漂泊在大海上面，生活状况非常的凄惨。
搜索没有持续多长的时间，斥候早就熟悉了所有的环境，经过特殊训练的他们，能够在任何的情况下，搜寻既定的目标。
陆续有一些金银珠宝被找出来了。
看着这些被搜出来的金银珠宝，苏天成的脸色变化了，他对这些商贾，印象本来就不好，这些商贾，和曾经的流寇首领一样，认识固定了，没有什么改造的可能，而且这些人熟悉福建的情况，曾经大肆贿赂福建各地的官吏，包括郑芝龙，都得到了他们的好处，要是继续留着，说不定什么时候，就要制造出来更大的麻烦。
苏天成最为担心的问题，就是这些搜出来的财富，他绝不会将这些财富，上缴给朝廷的，这些财富，肯定要运送到台湾去，作为台湾发展的资金，这个消息，不能够泄露，否则会惹下不少的麻烦。可惜这些商贾是清楚的，一旦有机会了，这些商贾乱讲话了，传到了朝廷，传到了朱由检的耳朵里面，就是麻烦。
所以说，找机会和理由，杀掉这些商贾，是最好的选择。
苏天成挥挥手，脸上没有什么表情。
刘铁汉和王大治很快明白了，命令将士，，将这些商贾架出去。
在商贾大声的求饶声中，钢刀举起来了，一颗颗的头领被砍下来了，一股股的鲜血喷向了半空中。
苏天成脸上没有什么表情。
黄金白银和货物，在最快的时间之内，运送到船上去了。
金门岛留下了五百人，这些人全部都是以前郑芝龙和郑鸿逵的手下，他们驻扎在金门岛，暂时维持这里的秩序，让一些被迫离开金门岛的渔民回来，恢复以前的景象，至于说建设金门岛的事宜，苏天成还没有考虑，金门岛距离厦门岛的距离太近了，还是留给朝廷去直接管辖，自己的重点，还是在台湾和澎湖列岛。
计划攻占金门岛是三天的时间，可一天的时间，所有的问题都解决了，盘踞在金门岛的势力，被剿灭的干干净净，那些跟随商贾在金门岛横行肆掠的护卫，这个时候全部成为了苦力，开始在岛上做农活了，其中一些骨干，被揭发出来之后，被毫不留情的斩杀，剩余的六百多人，被看管的严严实实，不敢有丝毫的异动。
郑成功带领部分的战船，在金门岛的四周，进行了搜索，看看还有没有落网之鱼，结果是令人欣慰的，四周没有残余势力了。
二月二十三日，大军离开金门岛，朝着澎湖列岛的方向前进。
金门岛的这次战斗，不能够算是真正的战斗，但江宁营的收获是非常大的，巨大的财富，是最大的收获，建设台湾，需要大量的资金，更需要粮食、布匹、食盐、茶叶等生活物资，毕竟台湾的生产能力是不足的，想要改变这样的状况，至少需要两年以上的时间，两年之内，台湾的建设，重点还是要依靠输血机制的，需要来自内地的援助。
苏天成很清楚，仅仅有金银珠宝的支撑是不够的，台湾岛想要发展起来，必须要有着不一般的生产能力，能够种出来大量的粮食，能够自给自足，这样的情况下，才能谈得上经济的飞速发展，否则台湾的基础不牢固，就经不起波折，稍微遭遇一些变故，情况就很是不妙。
苏天成的主要精力，暂时无法放到台湾，否则他的做法是不一样的，会运送大量的物资到台湾去，可现在不行，因为后金鞑子的实力还是非常强大的，他和江宁营的主要任务，依旧是首先剿灭后金鞑子，彻底摧毁后金政权，接下来长期有可能重点经营台湾。
船队航行的途中，苏天成一直都在思考这些问题，内部安定了，才能够说得上征服和称霸世界的事宜，否则一切都是空谈，朱由检的认识，恐怕不会达到那样的高度，剿灭了后金鞑子，朱由检就会满足了，剩下的事情，只有自己来做了，也正好趁着这个时机，远离朝廷，避免大明朝出现最大的内讧。