木叶四十八年，村子某处一座封印阵台上面正躺着一个金发婴儿，面前半趴着一道巨大的兽影，这正是九尾，而此刻九尾尖锐的爪子正刺穿着两人。
只见玖辛奈边咳血边颤声的说道:
“鸣人，不能挑食，要每天吃饱，茁壮的长大，记得每天都要洗热水澡……”
“另外要结交朋友，朋友不多也没有关系，有几个值得信赖的伙伴就够了。”
“说到忍者三禁，你还要小心自来也老师……”
水门在后面也静静地着看着这一幕，玖辛奈这时惭愧的说道:“抱歉，水门，就我说的起劲。”
水门摇了摇头:“不，没关系。”
又对着鸣人说道:“爸爸想说的，和你那啰嗦的妈妈一样。”
随后就开始施展八卦封印，将自己两人的查克拉意念封印在了封印空间深处，为封印九尾在上了一把锁。
因为封印的缘故原本正哇哇大哭的鸣人昏睡了过去，随后两人眷恋的看了一眼失去了生息，向后倒去。
随着两人死去，结界消失了，三代猿飞日斩带着守在外面的一众忍者奔向了封印阵台，抱起了昏睡的鸣人随即看向了倒在地上的水门和玖辛奈无奈叹息道“留下几人收敛尸体，其他人迅速去救助村里的难民”随后抱着鸣人去了火影大楼。
木叶的三大顾问志村团藏，水户门炎，转寝小春，早就来到了火影大楼。见猿飞日斩抱着鸣人走来，志村团藏上前
“日斩，把这孩子交给我，我会把他训练成最强的战争机器。”
虽然封印九尾的时候团藏并没有在场，但是他在现场附近安排了根部的人，所以，他也知道四代把九尾封印在了鸣人身上。他可不会在乎鸣人是谁的儿子，此刻他内心的想法不外乎是火影之位，四代战死，如果他把九尾据为己有，那火影之位就非他莫属了
“不可能，这可是四代的儿子，就算他是九尾人柱力，也不能把他当做战争武器培养。他以后将会是火之意志继承人”
猿飞日斩盯着团藏语气森冷。
同为二代火影的弟子，他怎么可能不知道团藏此时的想法，并且四代夫妇刚刚战死，无论如何都不可能把鸣人交给团藏。
“哼，如果九尾再次冲破封印呢？”这时的团藏仍不死心。
“这不劳你操心，如果九尾再次作乱，我会亲手封印它”说罢猿飞日斩抱着鸣人走进了办公室。
望着猿飞日斩的背影，团藏眯着的眼睛里闪烁着寒光“日斩，你会后悔的”
随即也朝着根部大本营走去。回到大厅，团藏召集几个戴着面具的忍者
“你们去村里散布漩涡鸣人是邪恶九尾的化身，随时会失控，不久将会重现九尾之乱。”只见几名单膝跪地的忍者答了声“是，团藏大人”随后就四散而开，朝村里疾驰而去。
火影办公室
猿飞日斩正仔细检查着鸣人身上的封印“这就是八卦封印么？果然一丝九尾的气息都感觉不到。”在确定鸣人身上封印没有问题后，猿飞日斩把鸣人送到了木叶医院。
“照顾好他，不能有一丁点损失”说完不待身旁的护士回应就转身走了。
护士看着昏睡的鸣人没有多想，只当鸣人是刚才九尾之乱之后留下的孤儿。随即把鸣人放在病床上便转身走出了病房。
几天后，漩涡鸣人是九尾妖狐的传言在村中越传越烈，几乎到了人尽皆知的地步。
这传言很快就被猿飞日斩知晓，这时的他已经重新接任火影，一是因为九尾之乱造成的死伤太过严重，村民们需要一个发泄点，二是波风水门仇家太多，如果让那些仇家之道他还有个孩子活着，还成为了九尾人柱力，那接下来木叶可能又要迎来战争了，所以他并没有站出来澄清这个谣言，而是选择隐藏鸣人是四代之子的事实。只是安排了几个暗部忍者去看守着鸣人
木叶医院，鸣人病房的门被人大力推开，只见一个身材肥胖穿着护士服的中年女人一脸狰狞的走向睡着的鸣人“就是你这妖狐害了我丈夫和儿子，你也去死吧”一边说着一边掐住鸣人的脖子，把他从床上提了起来。
睡熟的小鸣人突然被人掐住脖子猛然惊醒哇哇大哭起来，可是这女人并没有因为哭声而松手，而是更加用力，鸣人的哭声也越来越小。
就在鸣人脸色被掐的发紫快没气息的时候两个戴着面具的忍者跳窗而入，掰开了那女人的手，把鸣人放在床上拖着她离开了病房，但是他们也没多说什么，毕竟三代只是交代了只要人柱力别死了就行。
不一会猿飞日斩到了医院，看了眼晕过去的鸣人并没有多说什么，只是叮嘱院长人柱力绝对不能死。
因为三代的不管不问，鸣人所遭受的折磨越来越多，时不时会有人用针扎睡熟的他，刚冲的奶粉不管多烫都直接喂进去，就好像鸣人哭的越大声她们越高兴。三个月以后猿飞日斩把鸣人接出了医院送到了孤儿院。
到了孤儿院小鸣人的情况并没有好转，继续被折磨着，只是换了一个地方罢了。
随着鸣人慢慢的长大，当他学走路时摔倒了没人去扶，当他可以吃饭的时候他的饭里总会多一些沙子，菜总是馊的。没人愿意陪他玩，他想去和别的小孩玩时，他们都会叫他滚，骂他是妖狐。每当看到别的小孩一起玩时鸣人都会坐在旁边羡慕的看着。
猿飞日斩偶尔也会去看一下鸣人，每当鸣人问他为什么别人都欺负他，不喜欢他时，猿飞日斩都会洗脑般的告诉鸣人
“小鸣人哟，因为一些原因，大家都讨厌你，你要努力得到大家的认可，让大家都喜欢你。”
或许是因为一直被三代这样洗脑，亦或许是因为体内阿修罗查克拉的影响，鸣人并没有怨恨，蓝色的大眼睛仍然天真。只是觉得可能真的是自己做错了什么事，并没有多想其他。
三岁时鸣人向三代说了想自己一个人生活，三代也没多想，答应了鸣人，给鸣人安排了一间房子，还承诺了每个月给鸣人生活费，从此鸣人开始了独居生活。