林阿凤同黄阿旺率两万余海陆大军及林阿凤在碧瑶山中旧部、吕宋土着仆从军水陆并进大举南下进攻马尼拉城，林阿凤统率两万陆军横扫肥沃的吕宋平原，得到受尽土着和西班牙人欺凌的吕宋汉人踊跃支持，兵力迅速扩张到近三万。
吕宋汉人得到海东大军做靠山后展开反攻倒算，在西班牙殖民当局有意偏袒支持下没少欺负汉人的吕宋土着遭到吕宋汉人报复清算，残酷剥削汉人、土着的西班牙殖民者传教士纷纷遭到吕宋汉人土着报复杀死。
随着西班牙王国与大明的贸易逆差逐渐加大，西班牙菲律宾殖民当局借助菲律宾土着因汉人掌握当地经济命脉而产生怨恨，开始有意识地挑唆双方矛盾，并非常明显地拉偏架。致使汉商受到吕宋土着欺凌，甚至遭到打杀。
整个吕宋平原汉人及归顺海东大军的土着纷纷展开有仇报仇，有怨报怨，为虎作伥的土着遭到斩杀，残酷剥削汉人及土着的西班牙殖民者及传教士男子尽数被屠杀光，财产被海东大军没收。
黄阿旺率东海海军第三编队主力从玳瑁湾（林加延湾）南下一举攻占马雷维里斯（马里韦莱斯），随即横渡吕宋湾（马尼拉湾）攻占甲米地港口，俘获港口中两艘马尼拉大帆船以及甲米地港口造船厂中所有造船工匠。
黄阿旺在甲米地港稍作休整补给，随即率东海海军第三编队配合林阿凤统率的陆军及仆从军对马尼拉王城展开围攻，黄阿旺率东海海军第三编队直奔马尼拉王城杀来。
马尼拉王城最西北的圣地亚哥堡原本是用木栅栏围成，万历十八年（1590年），总督圣地亚哥·德维拉下令将城寨改建成石城堡，城墙外开挖有护城河，厚达10米的城墙上筑有塔楼，并设有炮台架，部署舰载加农炮做岸防炮防御。
林阿凤统率海东陆军及不断增多的土着仆从军三万余人正迅速南下杀来，直抵巴石河北岸，正在东面巴石河上渡河对马尼拉王城发起进攻。
西班牙王国第十任菲律宾总督弗朗西斯科·德泰洛·德古兹曼同雷克尔等马尼拉贵族将马尼拉城中五六千西班牙人组织起来凭借着星型西班牙王城抵抗海东大军围攻。
黄阿旺率东海海军第三编队赶到巴石河河口及西班牙王城城西沿海，黄阿旺站在旗舰飞月船上看着西班牙王城西北圣地亚哥堡上的西班牙将士正忙着备战，黄阿旺当即下令道：“准备迎战”
“是”传令兵忙打出备战旗语
五十余艘东海海军第三编队战船忙着备战，炮兵将士推着舰炮集中到战舰中间临时固定，集中火炮猛轰西班牙王城圣地亚哥堡，海军将士早已通过军情了解到西班牙王城是块更加难啃的硬骨头。
当年林阿凤突袭还在修建中的马尼拉西班牙王城时一度攻入马尼拉大街，杀死逼降千余西班牙人，但最终林阿凤攻取马尼拉还是也失败告终，不得不撤退北上玳瑁湾。
林阿凤攻取马尼拉城失败原因在于海盗武装一贯作战风格是先派出先锋突袭，顺利得手后再一拥而上，林阿凤手下得力将领浪人庄公率先锋部众一度攻占城外西班牙军指挥部杀死指挥官，但因兵力不足攻城不利被迫撤退，林阿凤随后率大军来进攻，遭到已经加强防御的西班牙人击退。
黄阿旺指挥东海海军第三编队在马尼拉王城及圣地亚哥堡沿海三里外一字排开发起进攻，海东海军战船上的舰炮瞄准马尼拉王城西城墙及圣地亚哥堡。
黄阿旺见炮兵将士已做好备战，挥手下令道：“发炮进攻”
东海海军将领纷纷高呼下令道：“放”
‘轰轰……’东海海军战舰上的舰炮接连发炮，呼啸抛射的炮弹直奔向马尼拉王城城墙袭来。
马尼拉王城星型城墙上四十来岁身形高瘦的菲律宾总督弗朗西斯科·德泰洛·德古兹身着拉夫领戎装，看着海东海军战船直抵沿海三里外发炮进攻，看着呼啸抛射袭来的炮弹一脸震惊不已道：“上帝啊，海东海军舰炮射程怎么会有这么远，完全超出我的想象了。”
弗朗西斯科·德泰洛·德古兹身边的卫兵忙疾呼道：“盾牌护卫总督”
几名刀盾兵忙举着盾牌掩护弗朗西斯科·德泰洛·德古兹，海东海军炮弹在马尼拉城墙上、城内、圣地亚哥堡上炸响，不断有西班牙兵武装人员鬼哭狼嚎惨呼声响起：“啊啊……”
东海海军一通炮击刚过，一身戎装的雷克尔跑过来禀报道：“禀报副王（总督），数万海东陆军带着土着仆从军正向城南杀来，我们兵力太少了。”
“该死的土着，海东军队怎么会有这么多？”弗朗西斯科·德泰洛·德古兹慌忙跑到城南看着黑压压一大片的海东陆军及土着仆从军前锋已经抵达城南，后阵还有不少将士正在东面巴石河上渡河，弗朗西斯科·德泰洛·德古兹惊呼道：“上帝啊，我们真不应该与海东国开战，都是该死的达斯麻雷那斯那个疯子怂恿国王发动的这场战争。”
雷克尔的雄心壮志和征服大明的野心勃勃狂言早已被抛之脑后，如今更是担心马尼拉王城是否还能守住，一旦城破，所有西班牙人都将会被杀死，雷克尔见总督弗朗西斯科·德泰洛·德古兹看向自己忙解释道：“我已经意识到这是不可能的事，但是远征军总指挥官达斯麻雷那斯还是非常固执地坚持征服大明。”
弗朗西斯科·德泰洛·德古兹对守住马尼拉王城还是很有信心，星型城堡不是轻易就被攻破的，不然西班牙王国怎么会容忍尼德兰人还在继续闹独立，弗朗西斯科·德泰洛·德古兹当即下令道：“我们得尽快派人出城南下赶去宿务渡海向新西班牙总督请求援兵增援马尼拉王城。”
雷克尔欣然赞同道：“副王说得太正确了，我们得赶快调集援军赶来解围。”
林阿凤指挥三万余陆军及土着仆从军在城南正井然有序展开围攻战，林阿凤也深知西班牙人修建了三十年的马尼拉王城比当初自己突袭进攻时还要更加难以攻下，不是一般的硬骨头，早已做好了长期围攻战。
黄阿旺指挥东海海军第三编队接连发炮狂轰马尼拉往城及圣地亚哥堡，意图消耗马尼拉守城兵力，为最后攻城时减少将士死伤，黄阿旺将圣地亚哥堡视为重要炮击目标，集中近半战舰舰炮炮轰圣地亚哥堡。
一身山纹甲的林阿凤身披大红披风，胯下一匹火红战马，看着黄阿旺接连发炮炮轰马尼拉王城及西北的圣地亚哥堡，林阿凤当即下令道：“传令炮军发炮进攻”
“是”传令兵领命忙高呼道：“炮兵发炮进攻”
大军阵前炮军将士已将六十门200MM大口径大炮炮车排列成三排做好备战，炮军营帅胡彪当即下令道：“放”
‘轰轰……’海东炮军炮弹呼啸抛射向马尼拉王城城南城墙城中袭去，马尼拉城墙上城内一片轰隆巨响声响起，不断有西班牙兵武装人员被炸死炸伤惨呼声响起：“啊啊……”
弗朗西斯科·德泰洛·德古兹见海东海陆大军都是在舰载加农炮射程之外发炮猛轰，也只好放弃发炮反击，下令守城军民退到城中安全位置坚守，待海东大军炮击停止后立即上城墙坚守。
林阿凤指挥海东炮军炮轰掩护土着仆从军展开攻城战，土着仆从军扛着攻城梯木板小船在火炮掩护下在城南护城河上搭建浮桥发起攻城战，遭到守城西班牙军民拼死抵抗，双方死伤惨重，攻城战陷入持久战。
黄阿旺指挥东海海军第三编队接连炮轰两天马尼拉城墙后放弃继续炮轰，转而集中舰炮猛轰圣地亚哥堡，黄阿旺决心将圣地亚哥堡夷为平地，彻底将马尼拉王城西北的要塞屏障城堡抹掉，东海海军第三编队成了拆迁队。