在第二天的攻击当中，日本联合舰队遭到了毁灭性的打击，其主力舰大多数都已经带伤，但是由于现在整个战略形势的原因，日本联合舰队无法进行撤退。
在是否发动第二轮攻击，以及应该什么时候发动攻击多少战斗机才算是正常规模的思考当中，南云忠一作为联合舰队的指挥官，错过了一系列的反击事件，直到日本侦察机在尾随着太平洋共和国海军舰队的侦察机，发现了太平洋共和国航空母舰编队所在的位置之后，日本联合舰队才开始进行了一定的准备。
但是这一定的准备并没有为日本联合舰队构成什么实质性的优势在日本侦察机发现太平洋共和国海军航空母舰编队的时候，太平洋共和国海军航空母舰的第二攻击波也已经准备要出发了。
中午11:40，太平洋共和国海军航空母舰编队的第二攻击波从航空母舰上起飞，直奔现在已经遭受打击的日本联合舰队。
在经过40分钟的飞行之后与12:30抵达了日本联合舰队的航空母舰编队上空，对日本联合舰队发动了第二轮攻击，在此过程当中日本联合舰队也放飞了自己的第二攻击波，双方的攻击波直接擦肩而过，不过双方的规模却是不一样的，由于太平洋共和国海军舰队已经做好了充足的准备，所以这第二攻击波的规模要比日本联合舰队第二攻击波的规模大得多。
由于时间的问题，太平洋共和国海军航空母舰编队的第二攻击波首先抵达了战区上空，随即就对日本联合舰队发动了攻击，日本联合舰队在前一次的攻击当中已经损失了大量的防空火力，在这一次攻击当中所受的损失持续增加，最终在12:55的时候，日本航空母舰编队的第一艘航空母舰遭到了击沉，随即第二艘翔鹤号伤势加重。
在这种情形之下，日本联合舰队马上将战列舰调回到航空母舰编队周围，希望能够利用战列舰庞大的舰体以及上面强大的防空火力，来支撑整个舰队的防空。
但是很显然的问题是，日本联合舰队这一个作战行动最终没能够成功，不但没能够成功武藏号战列舰，甚至在遭到了另外三枚鱼雷击中之后，整体舰身开始大规模进水并且开始下沉。
此时的形势已经对整个日本联合舰队非常不易冷南云忠一现在在日本联合舰队的最高指挥舰上面也已经非常的清楚，现在的形势非常不利，但是他也无法撤出战场，如果日本联合舰队想要撤出战场的话，至少要等日本联合舰队发起的第二攻击波返回之后才能撤出战场。
事实上，南云忠一因为这个决定，非常有可能再也无法撤出战场了，在这种情况下，日本联合舰队的第二攻击波在抵达太平洋共和国海军航空母舰编队上空的时候遭遇到了惊人的反击。
第二攻击波损失异常惨重，甚至都没有来得及发动攻击的时候，就有超过13的攻击机被击毁，要知道太平洋共和国海军航空母舰编队，在经历了完善的准备之后，其环形防空圈防空火力异常的密集。
当南云忠一得知道自己放出的攻击波已经损失惨重，并且基本上没有任何取得胜利的成果之后，南云忠一最终决定要求联合舰队迅速向本土方向撤退。
但是现在的问题在于，日本联合舰队即便已经开始打算撤退了，但是他们也无妨平安的撤出现在的战区，在日本联合舰队撤退的过程当中，太平洋共和国海军航空兵编队发动了第三次攻击，第三次攻击，虽然说是在日本联合舰队撤退的时候做出的，但是实际上对日本联合舰队的打击最为巨大的就是这第三次攻击。
在此之前的前两次攻击，只是击沉了日本联合舰队的两艘航空母舰和一艘战列舰而已，对于其他的主力舰来说没有太大的损失，但是第三攻击波在赶上日本联合舰队撤退的时候，对日本联合舰队造成了毁灭性的打击，日本联合舰队剩下的四艘航空母舰当中有三艘被直接击沉，唯一的一艘航空母舰也被重伤，大和号战列舰遭到了大规模的攻击，甚至差一点就没有能够从战场上撤离。
而日本除了这五艘航空母舰沉没的巨大打击之外，要知道对于日本来说更为重大的打击就是日本航空兵的损失异常之惨重，这一次海战基本上标志着整个日本联合舰队再也无法拥有之前那样大规模的海军航空兵了。
与此同时，日本联合舰队的战列舰编队，除了武藏号之外，其他的两艘战列舰也在这次大规模的交战中被击沉。
在这种情形之下当趁着夜色，日本联合舰队在遭受了一整天的攻击之后，终于可以向本土方向进行撤退了，不过虽然在本土方向撤退，但是他还是被一艘美国潜艇发现，最终那唯一的一艘幸存的航空母舰在美国潜艇的攻击当中沉没了。
当1941年的3月14号来临的时候，无论是日本东京还是太平洋共和国的首都洛川，亦或者是美国华盛顿。
都处于非常巨大的震惊当中，日本东京现在已经是哀鸿遍野，要知道你日本海军现在全员处于非常震惊的状态，这一次出去没有能够取得任何的成果，但是代价却异常的惨重，日本联合舰队丢掉了几乎所有的航空间，除了现在在本土正在建造的两艘和正在维修的一艘之外，所有的航空母舰已经全部被继承了，而战列舰也损失了超过一半以上两艘超巨型战列舰大和号身受重伤，武藏号被直接击沉。
而对于另外的两个国家太平洋共和国和美国来说，现在他们所需要做的事情就是非常简单的了，那就是庆祝在这一次海战结束的消息传来，并且战果最终对揭露出来的时候，无论是太平洋共和国的首都洛城还是美国的华盛顿都进行了大规模的庆祝活动。